Используйте свежую версию phpMyAdmin.

Пользовался раньше сайпекс дампером. Он внешние ключи добавляет в дамп, но последовательность воссоздания таблиц при импорте должна быть иной (вначале должна идти таблица на которую ссылаются, а затем которая ссылается). Приходилось вручную каждый раз переставлять таблицы местами. Что очень напряжно. У сайпекс дампер есть одна особенность, которая мне нравится - можно обращаться из своего клиентского приложения с помощью гет/пост запросов.

Т.к. сайпекс мне надоел (ввиду изложенных причин), то взгляд упал в сторону пхпмуадмина, но при экспорте я не вижу в создаваемой структуре конструкций вида Foregn key. Помогите разобраться, пожалуйста.