CREATE TABLE IF NOT EXISTS `test` (
  `id` varchar(200) NOT NULL,
  `test2` varchar(200) NOT NULL
) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=cp1251;

затем файл который выложили удалив первый столбик где # импортируйте если все верно значит структура у Вас все же не верна.

--
-- Структура таблицы `test`
--

CREATE TABLE IF NOT EXISTS `test` (
  `id` varchar(200) NOT NULL,
  `test2` varchar(200) NOT NULL
) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=cp1251;

в вашем файле удалил первый столбец с # , сохранил как CVS разделители запятые, данные занеслись в таблицу коректно при импорте выбрал файл и указал кодировку cp1251

какая структура у вас у таблиц и в базе какая кодировка по умолчанию?
выложите дамп структуры таблицы.

если не поможет попробуйте загрузит к себе локально и выгрузить в формате SQL для заливки на хостинг и проверите результат.

а так что вышло? у себя как на локальном через PMA отображаеться?