Все верно. Лично для меня, ручная установка предпочтительна из-за более высокой скорости обновления. Через командную строку достаточно скачать, распаковать в нужный каталог и подменить конфигурационный файл config.inc.php, плюс возможность быстро сменить пользователя файлов скрипта, чтобы они не были под root.

Понял! Спасибо Вам за ответ!

Совершенно верно, отличие только в этом, но для некоторых людей этого достаточно, чтобы выбрать именно репозиторий, а не ручную установку. В остальном, отличий нет никаких.

Спасибо за ответ! Спрошу дальше, так как интересно разобраться до конца: Вы написали "для некоторых людей этого достаточно". А в каких случаях этого может быть не достаточно?

Самостоятельно вижу такие варианты:

1. В репозиториях скрипт идет с отставанием в несколько версий.
2. Ручная установка в отличие от автоматической позволяет установить скрипт в любое место файловой системы.
3. Ручная установка, в конце концов, дает ощущение полного контроля над происходящим.

Может есть еще что-то?

Только лишь тем, что все вышеперечисленные действия по установке и настройке производятся автоматически, и скрипт может обновляться через систему обновления Ubuntu?

Совершенно верно, отличие только в этом, но для некоторых людей этого достаточно, чтобы выбрать именно репозиторий, а не ручную установку. В остальном, отличий нет никаких.

Интересует такой вопрос: в Windows я всегда устанавливал phpMyAdmin вручную - скачивал архив, распаковывал в директорию сервера, правил конфиг, и после этого все начинало работать. Сейчас осваиваюсь в Ubuntu, и обнаружил, что phpMyAdmin можно установить из центра установки приложений. Вопрос: чем отличается ручная установка от автоматической из репозитория? Только лишь тем, что все вышеперечисленные действия по установке и настройке производятся автоматически, и скрипт может обновляться через систему обновления Ubuntu?