Причину ошибки я объяснить не могу. Попробуйте обновить или поставить отдельно новую версию phpMyAdmin прямо на хост.

Можете проверить работу на тестовом сервере. Не вижу, чтобы переносы строки убирались.
http://demo.phpmyadmin.net/STABLE

Подскажите какие логины?
Хотя, не совсем понимаю что это может дать. У меня дома и на остальных хостингах все в порядке. А с таким эффектом я столкнулся впервые (хостинг DigitalOcean). Я думал дело в каких то установках, PHP-MyAdmin, которые стали по умолчанию.

Я в пост выше добавил пошаговую схему, как проявляется этот глюк.

Уточните тип поля. Переносы строки убираться не должны.

Тип поля text.

Затирание переносов происходит именно в момент вставки текста в поле ввода, т.е. еще до обновления на сервере. Сталкиваюсь с таким поведением впервые. Версия PHP-MyAdmin 4.2.11

===========
В дополнение приведу весь порядок действий:
Попробовал с другого браузера.

1. Вызываем режим редактирования - ячейка пустая:

2. Вставляем форматированный текст:

в нижнее! поле ввода:

В принципе, уже на этом этапе видно, что текст в верхнем поле ввода, в которое он перекидывается автоматом, уже потерял ентеры.

3. Если на этом этапе, еще до обновления на сервере, скопировать текст с нижнего поля:

То он еще будет сохранять ентеры.
Но если тут же попробовать выделить текст в верхнем поле ввода:

То уже сразу видно, что в нижнем поле, текст обновился и уже так же не содержит ентеры, как и верхнее поле.
После связи с сервером соответственно получается текст без ентеров.

Если текст изначально вставляется в верхнее поле, то он сразу же зачищается от ентеров.

Можно ли как то настроить, чтобы ентеры не убирались?

Уточните тип поля. Переносы строки убираться не должны.

вот такое получается при обратном копировании из PHP-MyAdmin в редактор:

Можно ли как то настроить, чтобы ентеры не убирались?