Документация здесь: http://php.net/manual/ru/ini.core.php#ini.open-basedir
Смотрите конфигурационный файл PHP (php.ini).

Вот содержимое файла. Нет у меня такой команды. Где искать?

(php.ini)

А где искать-то этот файл (php.ini)?

file_exists(): open_basedir restriction in effect. File(doc/html/index.html) is not within the allowed path(s): (/usr/share/phpMyAdmin/:/etc/phpMyAdmin/:/var/lib/phpMyAdmin/upload:/tmp/:/usr/share/php/:/var/lib/php/session/)

Срабатывает ограничение директивы open_basedir в настройках PHP. Файл (doc/html/index.html) отсутствует в разрешенных каталогах.
(/usr/share/phpMyAdmin/:/etc/phpMyAdmin/:/var/lib/phpMyAdmin/upload:/tmp/:/usr/share/php/:/var/lib/php/session/)

Что нужно сделать? Как добавить этот файл, что должно быть в нем?

Срабатывает ограничение директивы open_basedir в настройках PHP. Файл (doc/html/index.html) отсутствует в разрешенных каталогах.
(/usr/share/phpMyAdmin/:/etc/phpMyAdmin/:/var/lib/phpMyAdmin/upload:/tmp/:/usr/share/php/:/var/lib/php/session/)

У меня на VPS стоит CentOS
Обновил версию MySQL    до 5.5.48-33.el6.art
Когда захожу в phpMyAdmin показывает кучу ошибок:
1.
Warning in ./libraries/Util.class.php#516
file_exists(): open_basedir restriction in effect. File(doc/html/index.html) is not within the allowed path(s): (/usr/share/phpMyAdmin/:/etc/phpMyAdmin/:/var/lib/phpMyAdmin/upload:/tmp/:/usr/share/php/:/var/lib/php/session/)

Backtrace

./libraries/Util.class.php#516: file_exists(string 'doc/html/index.html')
./libraries/Util.class.php#540: PMA_Util::getDocuLink(
string 'faq',
string 'faq7-2',
)
./libraries/display_select_lang.lib.php#59: PMA_Util::showDocu(
string 'faq',
string 'faq7-2',
)
./index.php#231: PMA_getLanguageSelectorHtml()

2.
Warning in ./libraries/Util.class.php#516
file_exists(): open_basedir restriction in effect. File(doc/html/index.html) is not within the allowed path(s): (/usr/share/phpMyAdmin/:/etc/phpMyAdmin/:/var/lib/phpMyAdmin/upload:/tmp/:/usr/share/php/:/var/lib/php/session/)

Backtrace

./libraries/Util.class.php#516: file_exists(string 'doc/html/index.html')
./index.php#390: PMA_Util::getDocuLink(string 'index')

3.
Warning in ./libraries/Util.class.php#516
file_exists(): open_basedir restriction in effect. File(doc/html/index.html) is not within the allowed path(s): (/usr/share/phpMyAdmin/:/etc/phpMyAdmin/:/var/lib/phpMyAdmin/upload:/tmp/:/usr/share/php/:/var/lib/php/session/)

Backtrace

./libraries/Util.class.php#516: file_exists(string 'doc/html/index.html')
./libraries/navigation/NavigationHeader.class.php#170: PMA_Util::getDocuLink(string 'index')
./libraries/navigation/NavigationHeader.class.php#53: PMA_NavigationHeader->_links()
./libraries/navigation/Navigation.class.php#35: PMA_NavigationHeader->getDisplay()
./libraries/Header.class.php#418: PMA_Navigation->getDisplay()
./libraries/Response.class.php#263: PMA_Header->getDisplay()
./libraries/Response.class.php#276: PMA_Response->_getDisplay()
./libraries/Response.class.php#390: PMA_Response->_htmlResponse()
PMA_Response::response()

Пытался обновить phpMyAdmin, думал проблема в этом, но упорно ставится версия phpMyAdmin 4.4.15.5-1.el6.remi.

Я новечок в этом во всем. Помогите решить проблему. Напишите пожалуйста пошаговую инструкцию как решить данную проблему! Ооочень прошу.

Заранее благодарен.