Работа с несколькими БД

Сейчас проектирую БД для нескольких систем, которые будут работать на одном сервере. У этих систем есть общие таблицы с настройками и справочниками. И у меня возник вопрос: как правильно организовать БД.
Логичнее всего, как я понимаю, выделить для таблиц с настройками отдельную базу, и для каждой системы создать свою.
Но тут у меня возникли проблемы с реализацией.
1. В phpmyadmin'e я не вижу как можно создать связь между таблицами из разных баз данных.
2. При написании кода (пользуюсь фреймворком yii) будет много головной боли с настройками под две бд.
Можно сделать одну базу со всеми таблицами систем и справочниками. Но в таком варианте меня беспокоит быстродействие СУБД. Базы данных ожидаются размером до 1-2 Гб.

Может посоветуете что-то?