Дублированная база.

Доброго времени суток.
Несколько дней назад основная база на моем сервере начала непонятным образом перескакивать между двумя разными состояниями. Переход этот происходит случайным образом без каких-либо видимых причин. В итоге в разные момент времени я работаю с двумя разными БД, и изменения в одной никак не отражаются на другой.
Может ли кто подсказать в чем может быть проблема и как ее решить?

Server version: 5.1.41-3ubuntu12.7
Apache version: 2.2.14 (Ubuntu)
phpMyAdmin version: 3.3.2deb1