nickspring и все, все, все. 
К сожалению данные ограничения накладывает не веб интерфейс, как таковой, а настройки PHP интерпретатора. По умолчанию, принятому на абсолютном большинстве хостингов, параметр max_execution_time, отвечающий за максимальное время выполнения скрипта, в конфигурационном файле PHP, стоит на 30 секундах. То есть любой скрипт не может выполняться более 30 секунд, и если это происходит, то выполнение прерывается и вызывается ошибка.
В основном (default) конфигурационном файле phpMyAdmin существует директива отвечающая за длительность выполнения скрипта - $cfg['ExecTimeLimit'], которая по умолчанию стоит на 300 секунд. Но её выполнение зависит от функции PHP - set_time_limit(), выполнение которой возможно, только в случае выключенной конфигурационной директивы PHP - safe_mode (безопасный режим), что на хостингах, зачастую, встречается.
То есть решением проблемы импорта дампа большого размера, может быть следующее:
Если вы можете изменить конфигурационный файл PHP - php.ini, то можно временно заменить значение директивы max_execution_time, либо выключить "безопасный режим" и затем установить необходимое значение директивы $cfg['ExecTimeLimit'] в конфигурационном файле phpMyAdmin (config.inc.php).
Если "безопасный режим" выключен, то всё предельно просто, необходимо только установить директиву $cfg['ExecTimeLimit'], в конфигурационном файле phpMyAdmin (config.inc.php), в то значение, которое будет вас устраивать (это если вы считаете, что не хватит установленых пяти минут). Для справки: значение считается в секундах - то есть: 60 - минута; 300 - пять минут; 0 (ноль) - бесконечность.
В случае если вы не имеете доступ к конфигурационным файлам (а, как правило, так и бывает), то необходимо воспользоваться сторонними программными средствами управления БД. Для MySQL таким средством может быть MySQL Administrator, созданный разработчиками данной БД. Только не забудьте в CPanel (если используется именно она) установить соответствующие настройки доступа.
Хотя особо усидчивые могут импортировать содержимое дампа вручную, частями, через phpMyAdmin. Но при размере дампа около 50 мегабайт, данное ковыряние затянется надолго.
Если честно, то хотелось бы закрыть данной статьёй вопросы по импорту и экспорту дампов большого размера с помощью phpMyAdmin. Надо понимать, что phpMyAdmin - это не средство восстановления и сохранения дампов БД, а средство управления данными БД.