Hanut сказал:Уточните тип поля. Переносы строки убираться не должны.
Тип поля text.
Затирание переносов происходит именно в момент вставки текста в поле ввода, т.е. еще до обновления на сервере. Сталкиваюсь с таким поведением впервые. Версия PHP-MyAdmin 4.2.11
===========
В дополнение приведу весь порядок действий:
Попробовал с другого браузера.
1. Вызываем режим редактирования - ячейка пустая:

2. Вставляем форматированный текст:

в нижнее! поле ввода:

В принципе, уже на этом этапе видно, что текст в верхнем поле ввода, в которое он перекидывается автоматом, уже потерял ентеры.
3. Если на этом этапе, еще до обновления на сервере, скопировать текст с нижнего поля:

То он еще будет сохранять ентеры.
Но если тут же попробовать выделить текст в верхнем поле ввода:

То уже сразу видно, что в нижнем поле, текст обновился и уже так же не содержит ентеры, как и верхнее поле.
После связи с сервером соответственно получается текст без ентеров.
Если текст изначально вставляется в верхнее поле, то он сразу же зачищается от ентеров.